自与戈鲁戈姆的激战过去了半年，本应恢复和平的时刻却被怪魔界克萊西斯帝国打破。克萊西斯帝国的杰克将军妄图拉拢南光太郎为自己效力，然而光太郎坚决拒绝了他的请求。于是，杰克将军采取了破坏光太郎变身机能的手段。在变身机能被破坏的情况下，光太郎被抛入宇宙中。就在他即将被宇宙尘埃吞噬之时，一道神秘的太阳光线照射到了他的身上，激发了他体内的帝王石的力量，使光太郎蜕变为全新的身姿——太阳之子，也被称为假面骑士BLACKRX。从此，他踏上了与克萊西斯帝国的战斗征程。gt